こんにちは、minoruです。
sedコマンドで置換するのは慣れれば便利だし、難しくも無いのですが、改行の取り扱いに関してはややこしい。結局ubuntuのデフォルトの環境では以下で成功。
sed -e ':loop; N; $!b loop; s/\n/置換する文字/g'
ちなみにコマンドを途中で改行して…という手法もあるようですが、私の環境では上手くいきませんでした。
通常の文字を改行に置換する場合は…
's/hoge/\n/g'
で置換できました。
補足
上記のようなコマンドにしなくても、改行を削除するだけであれば…
cat ファイル名 | tr -d '\n'
このようにtrコマンドでもいけるけど、Ubuntu上で普通に作成されたテキストファイルなら問題無いが、Window上で作成されたものだと改行コードが異なったりして、上手くいかない事もあるので注意が必要。